Siendo aún estudiante, ya era considerado el tenor más reclamado del país, y ha actuado en las principales capitales musicales de Europa, de los Estados Unidos de América y de Asia. Es invitado permanente en los festivales que gozan de mayor reputación mundial, incluidos el de Berlín, Leipzig, Halle, Ansbach, Salzburgo, Boston, Toronto, Rio de Janeiro, Japón e Israel. Recientemente, ha actuado como artista invitado con la  Vienna Academy en el Osterklang-Festival de Viena, y en la celebración de la designación de  Capital Europea de la Cultura de la ciudad de Salamanca. También ha cantado con la Cologne Chamber Orchestra, en la Kölner Philharmonie y en el Théâtre des Champs Elysees de París.

Trabaja asiduamente con las principales orquestas de Europa y de América y con directores tan destacados como Andrew Parrot, Frieder Bernius, Robert King, Peter Neumann, René Jacobs, Michael Schneider, Gary Bertini, Hermann Max, Helmuth Rilling, Martin Haselböck, Helmut Müller-Brühl, y otros. Aunque se ha hecho particularmente famoso por sus interpretaciones de música antigua, su repertorio combina todos los estilos y tipos de música, desde el Barroco antiguo hasta la música contemporánea; además, está desarrollando un repertorio operístico cada vez más amplio.

A lo largo de los últimos años, ha cantado en producciones de ópera bajo la dirección de Christoph Spering, Wolfgang Katschner y Michael Schneider; en la Schlosstheater Sanssouci, en el Hans-Otto-Theater Potsdam, así como en diversos festivales. Su última actuación como artista invitado ha sido la interpretación del papel de Adastro de la Antigona de Traettas, bajo la dirección de Paul Dombrecht, en Bruges, Antwerp, Salamanca y Bruselas. Coronó con gran éxito la temporada de conciertos de 2002/2003, cantando el Alessandro de  Il re pastore, de Mozart, con el  Ensemble Transparant, en Antwerp y en Bruselas, además de que le fuera asignado el papel de Kreonte de la Antigona de Traettas en el Stadttheater Gießen. En septiembre de 2003, fue Monostatos de The Magic Flute, de Mozart, bajo la dirección de Marc Minkowski, en ocasión de la espectacular actuación de La Fura dels Baus en la RuhrTriennale. Su programa de la temporada de conciertos de 2003/2004 incluía la interpretación del papel de Eisenstein de Die Fledermaus, de Johann Strauß, en el Stadttheater Gießen, y el de Kudrias de Katja Kabanova, de Janaceks, en el Stadttheater Bielefeld.

La pasada temporada cantó Monostatos de The Magic Flute de Mozart en el Teatro Real de Madrid, role que interpretó también en la Staatsoper de Stuttgart, y en Japón cantó el Messiah con la Tokyo Symphonie Orchestra.

La crítica musical se muestra unánime en alabar el don musical de Markus Brutscher, tanto por su extraordinario timbre de voz como por su técnica vocal y su abrumadora maestría estilística en todas las lenguas. Ha sido también aclamado a nivel internacional por el infalible compromiso que ha adoptado respecto a la música contemporánea. Sus más de 50 grabaciones para Sony Classic, EMI, Capriccio y Thorofon son muestra de su versatilidad como cantante.

 Aparte de esta extraordinaria carrera como cantante, está componiendo una misa sinfónica.