Nacido en Barcelona, cursa sus estudios musicales en la Escolanía de Montserrat y en los Conservatorios de Badalona y Barcelona. Completa su formación junto a  Benet Casablancas, Josep Soler y Antoni Ros-Marbà.

Manuel Valdivieso es uno de los directores más polifacéticos de su generación, con una amplísima actividad que incluye desde producciones con repertorio barroco y clásico con grupos especializados (Orquesta Barroca de Sevilla, Il Fondamento, Orchestra Barocca Italiana,...) hasta importantes estrenos de compositores actuales, con una dedicación especial en estos últimos años a la música sinfónica y la ópera.

Ha dirigido las principales orquestas de España, como la Orquesta Nacional de España, RTVE, Real Filarmonía de Galicia, Ciudad de Granada y las Sinfónicas de Madrid, Galicia, Bilbao, Sevilla, Málaga, Baleares, Tenerife y otrs destacadas agrupaciones Europeas y Norteamericanas. Desde 2001 es Director Titular de la JONC (Joven Orquesta Nacional de Cataluña), sucediendo en el cargo a Josep Pons.

Su llegada al repertorio lírico se produce al lado de directores como Alexander Anissimov, Maurizio Benini o Wladimir Jurowsky, participando asíduamente desde el año 2000 en las temporadas del Teatro Real en Madrid y el Gran Teatre del Liceu en Barcelona. En los últimos años ha debutado en ambos teatros así como tambien en el Washington Opera House, invitado personalmente por Placido Domingo. El éxito de público y crítica de estas producciones impulsan definitivamente una actividad operística de una gran proyección que incluye títulos como  Il Trittico, Tosca, Madame Butterfly, Turandot,  L’Elisir d’Amore, Lucia di Lammermoor, The turn of the Screw, Il Trovatore, Carmen y La sonnambula entre otras.

Ha grabado para Harmonia Mundi, Naxos y Columna, particularmente producciones dedicadas a compositores actuales (B.Casablancas, A.Llanas,…) y entre sus proyectos para la temporada 2008 destaca su debut en la Ópera Nacional de Seul (Corea del Sur) con Lucia di Lammermoor (Marzo 2008),  y distintas producciones con la BOS (Orquesta Sinfónica de Bilbao), la OFM (Orquesta Filarmónica de Málaga) y la OBC (Orquesta Sinfónica de Barcelona y Nacional de Cataluña).